若手の男性教師と良家のご令嬢のちょっとだけ不器用な恋を描いたソフトさーくるクレージュ「箱入少女 -Virgin Territory-」は、ヒロインを甘い言葉で誑し込むのも、強引に脅迫して手籠めにするのも自由。
しかし、不純な動機で近づいた主人公もまた接するうちにヒロインに対して特別な感情を抱くようになってしまう……。

主人公は伝統ある名門女子校で教鞭を振るう若手の男性教師。良家のご令嬢だらけのはずが、放っておいても言い寄ってくる女生徒達。彼女たちを甘い仮面と巧みな話術で誑かしていた主人公も、空しさは募るばかりだった。

そんな折、クラスで孤立気味になっていた気弱な美少女「桐原ユキノ」の姿が彼の目に止まる。……桐原さんは“本物”だから、近寄りにくい。

同級生にも一目置かれる気高い少女の姿は、久しぶりに主人公の食指を動かした。主人公は教師として真剣に彼女の相談を乗りつつ、次なるターゲットとして見定めていく。桐原もまた、その内に主人公へ淡い好意を募らせていくのだが……